1942 августа. Нацисты захватили всю Европу и сейчас их взгляд направлен на единственную могущественную сверхдержаву - Советский Союз. Немецкие ученые создают новое смертельное химическое оружие. Ключ к победе нацистов – это падение Сталинграда и Нацисты планируют напасть, как только они завершат свой секретный проект. Вам отведена роль сотрудника советской спецразведки, а задачей будет – проникнуть в тыл врага, совершить ряд диверсий и остановить разработку смертельного химического оружия. Спасите город и измените ход войны.

Действие игры происходит в 2010 году. После событий, произошедших в первой части, прошёл один год, а в городе Эдвард-сити продолжают проводиться эксперименты с «третьей энергией». Один из них не удаётся и весь город отправляется назад во времени, попадая в доисторические джунгли.

Вторая мировая война близится к своему завершению. Армии СССР рвутся к горящему Берлину, одерживая одну победу за другой. В это время командованию американской стратегической службы становится известна шокирующая информация: по личному указу Сталина советские войска, невзирая на многочисленные потери, должны первыми войти в Берлин, дабы единолично завладеть материалами немецкой программы ядерных исследований и затем использовать захваченное секретное оружие в борьбе за победу мировой революции. Высшее руководство разведслужб США понимает, что никто не в праве обладать столь разрушительными технологиями, и поручает вам новое задание: проникнуть на территорию Берлина и уничтожить легендарное «Оружие Возмездия».